决策阶段控制工程预算的方法一般有：
1）进行多方案的技术经济比较，择优确定 建设方案；
2）建立科学决策体系，合理确定投资估算；
3）客观、认真的做好项目评价；
4）推行和完善项目法人责任制，从源头上控制工程项目投资。
工程预算编制过程要注意以下几点：
（1）了解工程的设计文件、技术文件、现场勘查情况和施工条件。
（2）按国际清单要求设定清单项目 ，准确表述工作内容与工作要求，规范使用计量单位。
（3）清单项目设置完整，不漏项。
（4）工程量计算必须准确，不然给投标人实施不平衡报价以可乘之机。
（5）根据工程项目的具体特点和实际情况，考虑适度的预留金，为准备充分的建筑资金提供依据，避免因资金缺口而影响工程进度，也防止工程严重超支。
单位工程预算的编制依据
(1)上级领导对该单位工程的要求、建设单位的意图和要求、工程承包合同、施工图对施工的要求等；
(2)施工组织总设计和施工图；
(3)年度施工计划对该工程的安排和规定的各项指标；
(4)预算文件提供的有关数据；
(5)劳动力配备情况，材料、构件、加工品的来源和供应情况，主要施工机械的生产能力和配备情况；
(6)水、电供应条件；
(7)设备安装进场时间和对土建的要求以及所需场地的要求；
(8)建设单位可提供的施工用地，临时房屋、水、电等条件；
工程预算建议的成本控制方法：
1、工程项目成本控制是以项目为中心，分层管理，分级核算的承包和核算体系。工程成本主要由人工费、材料费、机械费、其他费用组成，将四费落实到经营劳资、材料、机械各部门，进行责任考核，并与质量、、工期指标挂钩，建立激励约束机制。
2、作好成本核算，工程开工前，按照施工图作好成本预算，分析出人工、材料、机械的含量，并与中标预算作好对比。制定人才机的成本目标，若人工费为清包，可一次包死，不在调整，此项支出为固定值。材料费节省的前提必须实行材料招投标，实行质优价廉，以投标材料价为限额，特殊材料高于投标价的可平衡于其他低价材料。实行有目的的控制成本。
3、工程竣工后，进行成本核算。作好竣工结算，调整可调的价差，在竣工总价的基础上，进行成本分析，作好竣工成本分析资料，为今后的工程提供参考依据。
各单位工程预算编制要根据不同的预算定额及相应的费用定额等文件来进行。一般情况下，在充分熟悉掌握定额的内涵、工作程序、子目包括的内容、建设工程量计算规则及尺度的同时，深入建设工程线，收集资料、积累知识、着手编制。施工图预算编制有两种方法，种单价法，第二种实物量法，不管用哪种方法都需要依循预算编制程序及步骤。搜集资料，做好准备工作。项目的投资预测要做好需要的资料很多，比如工程所在地的水电路情况、地质状况、主要材料设备的价格、大宗材料的采购地及其现有已建的类似工程的资料。还要收集对于做经济评价的项目设立地的经济发展前景、周围环境、同行业的经营等相关资料。在编制前，预算人员应该先到工地现场对工程现场进行考察，熟悉施工工序、施工要求、技术要求及其新材料、新技术、新设备、新工艺在工程中的应用。详细研究施工图纸。预算在进行前，要对图纸仔细研读，必要的时候要与设计人员进行交流，对于图纸的设计情况要了解。各项工程量的计算。