工程预算审核以单位工种为标的，只对单位工程造价的合理负责。审计与工程造价审核是两个截然不同的专业学科，审计以会计师、审计师为主；而工程造价审核以工程经济和工程技术人员为主。目前 正在实程量清单计价的突出特点就是“量价分离、投标竟争”。工程量的产生依据施工图、设计变更、施工过程中产生的洽商来确定，费用产生的依据是由施工企业依据自身的施工管理水平确定的直接费、间接费、措施费、利润四部分的总和。
工程预算签证是施工合同和施工图中未包括，且预算定额取费也未考虑的，而实际施工中又确实发生费用的内容，需要做现场工程签证。一般由承包商提出，监理工程师或发包商核实签字批准。工程签证产生的原因主要有由于不可预见的因素产生的工程签证。如基础开挖时，发现有软弱下卧层等不良地基，需进行换填，这时需发包商现场管理人员核实后工程签证。一般来说在合同当中会就此做出相应的规定，例如因恶劣天气、一周内累计超过8小时的停水停电等造成的工期工程签证、经济工程签证等。
决策阶段控制工程预算的方法一般有：
1）进行多方案的技术经济比较，择优确定 建设方案；
2）建立科学决策体系，合理确定投资估算；
3）客观、认真的做好项目评价；
4）推行和完善项目法人责任制，从源头上控制工程项目投资。
工程预算编制过程要注意以下几点：
（1）了解工程的设计文件、技术文件、现场勘查情况和施工条件。
（2）按国际清单要求设定清单项目 ，准确表述工作内容与工作要求，规范使用计量单位。
（3）清单项目设置完整，不漏项。
（4）工程量计算必须准确，不然给投标人实施不平衡报价以可乘之机。
工程预算控制的原则:
（1）以设计阶段为重点的建设全过程造价控制
工程预算控制贯穿于项目建设全过程，在项目投资决策完成后，控制工程预算的关键就在于设计阶段。据统计，设计费一般不足建设工程全寿命周期费用的1%，但正是这少于1%的费用对工程预算的影响程度占到75%以上。
（2）实施主动控制，以取得令人满意的结果
传统的决策理论将人看作具有
