决策阶段控制工程预算的方法一般有：
1）进行多方案的技术经济比较，择优确定 建设方案；
2）建立科学决策体系，合理确定投资估算；
3）客观、认真的做好项目评价；
4）推行和完善项目法人责任制，从源头上控制工程项目投资。
工程预算编制过程要注意以下几点：
（1）了解工程的设计文件、技术文件、现场勘查情况和施工条件。
（2）按国际清单要求设定清单项目 ，准确表述工作内容与工作要求，规范使用计量单位。
（3）清单项目设置完整，不漏项。
（4）工程量计算必须准确，不然给投标人实施不平衡报价以可乘之机。
（5）根据工程项目的具体特点和实际情况，考虑适度的预留金，为准备充分的建筑资金提供依据，避免因资金缺口而影响工程进度，也防止工程严重超支。
工程预算保险费是指建设单位在建设期间向保险公司投保建筑安装工程险的费用。根据不同的工程类别，分别以其建筑、安装工程费乘以建筑、安装工程保险费率计算。工程承包费是指具有总承包条件的工程公司，对工程建设项目从开始建设至竣工投产全过程的总承包所需的管理费用。具体内容包括组织勘察设计、设备材料采购、非标设备设计制造与销售、施工招标、发包、工程预决算、项目管理、施工质量监督、隐蔽工程检查、验收和试车直到竣工投产的管理费用。该费用按 主管部门或省、自治区、直辖市协调规定的工程总承包费取费标准计算。施工机构迁移费是指施工机构由建设单位指定承担施工任务，由原驻地(指公司或公司所属工程处)迁移到工程所在地发生的往返一次性搬迁费用。包括被调迁职工(包括随同家属)的差旅费、调迁期间工资、施工机械设备、工具、用具、周转性材料等运杂费。引进技术及进口设备其他费用，
工程预算工程量清单计价模式，针对建设工程招标投标，在实际招标投标过程中，在统一建设工程工程量清单计价规范下，招标人进行工程量清单的编制与提供。然后，由投标人依据实际情况，结合工程量清单，进行初步施工方案的拟定，并结合自身情况实现自主报价。传统的定额计价模式已经不再适合现下建筑工程市场环境的需求，无法有效促进建设工程市场的发展，工程量清单计价模式正是在这种情况下应运而生，与传统的计价模式比较而言，这种计价模式具备以下四个优点：有利于构建优胜劣汰、平等竞争的环境。
工程预算清单控制的主要措施在实际的工程环境下，影响预算准确性的相关因素主要包括涉及方案的在进行施工的过程中，首先需要切实加强对于工程项目财务部门的管理，并从而进一步建立与相关部门配合工作的关系，能够保证整个施工过程的顺利进行。另一方面，要进一步建立与完善系统的监督部门，有效地实施对整个施工和管理过程的控制、调节与良好的预算。在这里主要是考虑到施工的预算过程都是在施工之前进行的，因此相关方面的市场价格以及 政策都有可能在后续施工的过程中发生变化。因此，在这样的情况下出现的预算偏差实际上也是无可厚非的，但我们还是需要针对于这样一种状况建立一个完善的检督体系来，从而能够随时根据市场以及政策动态来对价格管理系统进行及时地更新和修改，尽可能保证整个预算方案与施工本身的同步性。经济措施。一项工程项目在进行建设的过程中根本的目的是希望能够赢利，因此在整个项目进行的过程当中也会多方面地涉及到资金的筹措和使用。所以我们要认识到，在一个工程项目进行的过程当中要实现工程造价、工程质量以及工程进度的控制，对其实施一定的经济措施是完全必要的。