在烃中及气态下，黄石甲酸以通过以氢键结合的二聚体形态出现。在气态下，氢键导致黄石甲酸气体与理想气体状态方程之间存在较大的偏差。液态和固态的黄石甲酸由连续不断的通过氢键结合的黄石甲酸分子组成。由于黄石甲酸的结构特殊，它的一个氢原子和羧基直接相连。也可看做是一个羟基甲醛。 化学性质 黄石甲酸的酸性 黄石甲酸是脂肪酸中 在羧基上连有氢原子的酸，氢原子斥电子力量远小于烃基，使羧基碳原子的电子密度比其他羧酸低，又因共轭效应、羧基氧原子上的电子更偏向碳，所以黄石甲酸的酸性，强于同系列中的其他羧酸。黄石甲酸具有与大多数其他羧酸相同的性质，在通常情况下黄石甲酸不会生成酰氯或者酸酐。黄石甲酸在水溶液中是一元弱酸，酸度系数(pKa)＝3.75(at 20℃)，1％黄石甲酸溶液pH值为2.2。
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