工程预算利用工程定额规定的工作内容进行审查，验证工程决算工程量与定额中规定的工作内容是否一致来确定工程预算的真实性、合理性的一种审计技术方法。如某年我们对某单位一基建项目进行审计，从决算书中查出屋面防水工程子目中SBS防水以包含冷底子油的工作内容及其造价，施工单位报送的决算书中又单独计算冷底子油子目明显多计工程；由于SBS防水卷材铺贴时使用的是热熔法（北方），不需要在做沥青胶泥粘贴，甲方签证4mm的沥青胶泥不属实，SBS防水卷材在制造工艺中已含该部分内容，该建设项目工程决算重复工作内容报价、甲方违背原则不负责任签证工程预算核减10.6万元。
工程预算通过分析各项费用指标来找出工程预算审计的突破口，准确完整的反映工程的实际造价。如对某单位一建筑项目进行审计，审计人员通过审查发现该项目与以往审计过的某幢建筑物A的设计完全想同，经过测算该项目的经济造价指标和部分材料指标均高出A建设工程，审计人员进一步审计发现该项工程多计钢材16.3t；商品砼多计128.8m3。由于上年价格指数变动不大，且使用的是同一估价本，所以审计人员在审计过程中只考虑价差问题未考虑价格上涨指数，审计人员核减工程预算合计15.78万元。
工程预算在我国工程预算控制中的应用问题及建议：
（1）建设单位及施工单位不了解和不重视
我国以公有制为主体，多种所有制经济共同发展的基本经济制度决定了我国许多大中型建设项目的建设单位都是 ，且大多数建设单位对工程预算控制的重视远远不够，不少建设单位是想方设法把资金用完，而不是节约资金。施工单位则只注重承接业务，不注重对业主的承诺实现。
（2）价值工程的实施未贯穿于工程项目全生命周期
目前，我国大多数工程项目应用价值工程的造价控制都仅局限于某一阶段，如项目竣工结算阶段、设计阶段、材料采购阶段等
工程预算具体流程如下。
（1）构建信息库基于已有工程信息，包括工程特征因素与工程预算等材料，构建造价信息库。
（2）取值结合公路工程施工要求，明确各类特征因素，包括评价指标，确定数据取值。
（3）选取输入与输出向量基于模糊神经思想法，在造价信息库内，至少选择3个已完成施工的项目，作为基础数据，以供神经网络学习与训练。输入向量选择为各类特征因素值，输出向量为造价估算值。