工程预算如果是预算结算承包，审计的重点是核查乙方提出的设计变更资料是不是通过了原来设计部门的同意或是经过了甲方的签证，这里的重大设计变更有没有计划或者是主管部门的审批手续，变更工程量的计算是不是真实，套用定额与单价是不是合适且准确，设计变更的增减是不是同步，有没有巧立名目、自行定价、搭车收费的现象。预算加系数或是平方米等价已经承包，审计的重点原则上已经把预算的变动，加价系数等算在内，因此不应该再零星项目变动经济洽谈。如果是招标承包，审计的重点是结算应该按中标合同的标价执行，当然遇到特殊复杂工程可以调价，也要有补充的合同，否则就不应该在 的结算关头再另行加价。
工程预算编制的流程：
1.预算部经办人根据招标谈判约定条件，结合公司前期合同样本起草合同草案（技术质量及工期指标由工程部提供），该草案内容是经施工单位认可的内容。
2.将合同草案交律师审阅。
3.施工单位工程预算签字盖章后的合同，签交与律师审核见证。
4.合同经办人、工程预算主管、总经理助理签字认可。
预算部根据采购计划会同工程部拟定招标文件（预算部拟定经济费用指标、工程部拟定技术质量指标），向合格供方单位发放招标通知（电话或书面均可）工程分类定标：由工程部和预算部在合格供方单位中选择1~3家进行比较分析，然后共同确定中标单位。
工程预算的审核依据主要包括：
1、 有关工程建设和造价管理的法律、法规和方针政策。
2、施工图设计项目一览表、各专业施工图设计图纸和文字说明、工程地质勘察资料。
3、主管部门颁布的现行预算定额以及工程量清单计价规范。
4、施工组织设计或施工方案。
5、费用计算规则及取费标准。
6、预算工作手册或建材五金手册。
7、地区人工工资、材料及机械台班预算价格若有两次以上结算或签订两份以上合同产生两份以上结算时，在分次结算中要注意之前结算与之后结算的工程量衔接，之前结算一定要用文字或图示标（说）明已结范围和位置，之后结算要在结算前先核对之前各结算书已结时间段、位置和范围，避免重复。要求现场工程师在向成本控制中心报送资料中定要注明每次结算的实际施工位置或距离。
工程预算它是指审计人员亲临建筑物现场，对审计项目进行实地测量和观察，从而准确地审计已完工程建设项目的实际投资情况，发现疑点，验证事实，核实实际工程量，审定工程预算的一种方法。例如：某工程决算审计时审计人员经现场实际测量和观察，现场测的围墙工程量比实际工程量少68.6m；砼地坪工程量少120m2；以上两项核减工程预算12.36万元。它是指审计人员通过调查询问被审计单位参与基建项目管理的知情者，通过知情人事收集整理审计信息，以证实基建工程量与工程价款的真实性、合理性的一种方法。如审计人员某年对某单位一建筑基建工程决算进行审计，通过建设单位了解到该项目地板砖为甲供材，