决策阶段控制工程预算的方法一般有：
1）进行多方案的技术经济比较，择优确定 建设方案；
2）建立科学决策体系，合理确定投资估算；
3）客观、认真的做好项目评价；
4）推行和完善项目法人责任制，从源头上控制工程项目投资。
工程预算编制过程要注意以下几点：
（1）全面了解工程的设计文件、技术文件、现场勘查情况和施工条件。
（2）按国际清单要求设定清单项目 ，准确表述工作内容与工作要求，规范使用计量单位。
（3）清单项目设置完整，不漏项。
（4）工程量计算必须准确，不然给投标人实施不平衡报价以可乘之机。
严防利用分包工程项目之间交叉施工内容，多家分头重复计算工程预算和虚增变更签证。一个总承包工程，往往由多家分包单位施工，有些分包单位利用两个或几个单位交叉施工，或利用分包工程结算项目较多，结算力量薄弱，不清楚现场施工情况，对现场变更签证辨别力差等原因，分头多计工程量和现场变更签证，造成工程量计算重复叠加，骗取额外工程价款。分包工程材料费的审计。对分包工程材料费的审计，重点是对分包工程材料的使用情况和费用计算进行审计。掌握分包工程材料使用情况。将分包单位领用的甲供材料数量与预算分析用量及施工图纸设计量进行分析对比，严防甲供材料的超领和浪费，只有杜绝建筑材料的浪费，才能确保总承包方的经济效益。
工程预算计价的依据
1)工程预算定额:A预算定额B概算定额；
2)造价指标:A概算指标；B投资估算指标；C万元指标；
3)取费定额:A其他直接费定额；B现场经费定额；C间接费定额；D工程建设其他费用定额；E建筑安装工程计划利润率；
4)工期定额:A建设工期；B施工工期；
5)基础单价:A劳动力的单位价格:B材料单位价格；C施工机械台班单价；D设备费单价；
6)工程预算指数
全程参与和监督分包工程预算合同价格的确定。对分包工程价格进行客观公正、实事求是地复核和测算，使分包工程合同的标底价格、中标价格及签约价格做到心中有数，遵照高质低价的原则，选择出 分包方，以利于分包工程合同的顺利签订。参与分包工程合同条款审查。审查分包工程合同条款，主要审查合同价格条款和材料供应条款及质量保修条款。审查复核分包合同签约价格或费率是否为中标价格或费率；分包合同中材料供应条款是否明确甲供料的供应方式及自购料的质量、购买程序和验收程序是否合规，竣工结算时费用的计取方式；质量责任保修年限和保修金额是否符合 相关规定。