施工单位施工过程中对技术资料的未能完整归档或有意不建档，造成建设单位在工程竣工后无法建立完整的工程资料档案并按要求报送工程结算所需资料，从而使审计工作周期拉长、风险加大。这个问题也的确存在。不过，按照一般的情况，审计周期是按提供完整的资料开始计算的。除非你自己的要求没有到位，那也怨不得别人。什么叫风险加大？是你审计费用不够用了吧？既然做了审计这个行业，就要有这个思想准备，否则人家建设单位为什么出钱给你啊！建设单位缺乏工程技术专管人员和工程技术专业知识或工程技术人员职业道德水准不高，造成工程项目施工中不合规的变更签证增多，从而使得工程预算随意增大。
对施工单位而言，淄博工程预算是指建设工程承发包双方本着公平、公正、城市、信用的原则通过签订合同明确双方的权利和义务，而实现项目的预期建设目标的核心内容，即淄博工程预算。在项目施工阶段，工程签证是不可避免的，它将影响淄博工程预算及工单位的直接利益，故在工程施工过程中，控制好工程签证的管理工作，对施工单位来讲尤为重要。所谓工程签证就是指工程发承包双方在施工过程中，按照合同约定对支付各种费用（施工过程发生的与设计图纸、施工方案、预算项目或工程量不相符，需要调整淄博工程预算的）、顺延工期、赔偿损失所达成的双方意思表示一致的补充协议。互相书面确认的签证即可成为工程结算增减淄博工程预算的凭据。工程签证根据分类的标准不同可以进行不同的分类工程工期签证：主要是在实施过程中因主要材料、设备进退场时间及业主等原因造成的延期开工、暂停开工，工期延误的签证。招标文件中一般约定了工期罚则，在工期提前奖、工期延误罚款的计算时，工期签证发挥着重要作用。工程隐蔽签证：是指施工过程中对以后工程结算影响较大，资料缺失将无法补救，难以结算。主要有：基坑验槽记录、软地基处理、钢筋隐蔽验收等按签证的目的可以分成工期签证、费用签证按签证的属性可以分成由于工程延误而做的签证、由于工程变更而做的签证、由于合同终止而做的签证、由于工程加速而做的签证、由于意外或不可预见的风险而做的签证。
预算审核人员若能经常深入施工现场，就可以及时了解情况，如土方的类别鉴定，机械土方与人工土方的放坡系数和所套用的定额单价问题等，并能实事求是地调整原编预算。对于一些没有施工图或图纸不全的小型零星工程，验收时应进行测量，审核人员应深入施工现场参加测量，以取得调整或审核工程预算的依据，从而提高审核工作的质量。审核人员遇到工程有中有补充单价时，应深入现场，了解所提资料的准确性如资料中所提主要材料的名称、规格、型号是否相符，所需的数量是否基本一致，所需人工工日或机械台班数量是否属实等，都应与施工企业人员一起研究，调整补充单价。在某些工程预算中，列有施工图没有表示的那部分工程项目，例如渣土清理、渣木外运等，是否按定额要求或预算中列出的项目完成。通过参加竣工验收，能够了解这些情况，同时还能了解工程情况。预算审核人员，若能经常深入施工现场，对于了解并熟悉施工过程，了解并熟悉建筑安装工程新材料、新结构、新技术、新工艺等，都有一定的作用，甚至是决定性的作用。
严防利用分包工程项目之间交叉施工内容，多家分头重复计算工程预算和虚增变更签证。一个总承包工程，往往由多家分包单位施工，有些分包单位利用两个或几个单位交叉施工，或利用分包工程结算项目较多，结算力量薄弱，不清楚现场施工情况，对现场变更签证辨别力差等原因，分头多计工程量和现场变更签证，造成工程量计算重复叠加，骗取额外工程价款。分包工程材料费的审计。对分包工程材料费的审计，重点是对分包工程材料的使用情况和费用计算进行审计。掌握分包工程材料使用情况。将分包单位领用的甲供材料数量与预算分析用量及施工图纸设计量进行分析对比，严防甲供材料的超领和浪费，只有杜绝建筑材料的浪费，才能确保总承包方的经济效益。