决策阶段控制工程预算的方法一般有：
1）进行多方案的技术经济比较，择优确定 建设方案；
2）建立科学决策体系，合理确定投资估算；
3）客观、认真的做好项目评价；
4）推行和完善项目法人责任制，从源头上控制工程项目投资。
工程预算编制过程要注意以下几点：
（1）了解工程的设计文件、技术文件、现场勘查情况和施工条件。
（2）按国际清单要求设定清单项目 ，准确表述工作内容与工作要求，规范使用计量单位。
（3）清单项目设置完整，不漏项。
（4）工程量计算必须准确，不然给投标人实施不平衡报价以可乘之机。
工程预算它是指审计人员亲临建筑物现场，对审计项目进行实地测量和观察，从而准确地审计已完工程建设项目的实际投资情况，发现疑点，验证事实，核实实际工程量，审定工程造价的一种方法。例如：某工程决算审计时审计人员经现场实际测量和观察，现场测的围墙工程量比实际工程量少68.6m；砼地坪工程量少120m2；以上两项核减工程造价12.36万元。它是指审计人员通过调查询问被审计单位参与基建项目管理的知情者，通过知情人事收集整理审计信息，以证实基建工程量与工程价款的真实性、合理性的一种方法。如审计人员某年对某单位一建筑基建工程决算进行审计，通过建设单位了解到该项目地板砖为甲供材。
工程预算签证是施工合同和施工图中未包括，且预算定额取费也未考虑的，而实际施工中又确实发生费用的内容，需要做现场工程签证。一般由承包商提出，监理工程师或发包商核实签字批准。工程签证产生的原因主要有由于不可预见的因素产生的工程签证。如基础开挖时，发现有软弱下卧层等不良地基，需进行换填，这时需发包商现场管理人员核实后工程签证。一般来说在合同当中会就此做出相应的规定，例如因恶劣天气、一周内累计超过8小时的停水停电等造成的工期工程签证、经济工程签证等。
通常的工程预算分析方法有：
（1）单方造价指标法。通过对同类项目的每平方米造价的对比，可直接反映出造价的准确性。
（2）分部工程比例。基础、混凝土及钢筋混凝土等各占定额直接费的比例。
（3）专业投资比例。土建、电气、采暖通风等各专业占总造价的比例。
（4）工料消耗指标。分析主要材料每平方米的耗用量的分析。
道路工程内容
a)路基、路面、桥涵、防护、临时工程等章节主要内容基本一致。
b)公路预算定额含有完整的交通工程及沿线设施定额，包括、监控收费、通信、供电照明、绿化工程等内容，而在市政定额中，将绿化工程独立一册编制，照明工程则在安装工程定额中包括，并未放入市政定额章节中，尤其交通设施部分，市政定额既无专门定额，也无相似可套用定额，是市政定额的空白部分。
c)公路定额有隧道工程完整章节，在市政定额中并无涉及，这源于一般城市道路中很少涉及隧道，故而并未专门编制隧道定额。
d)公路定额因公路项目经常处于偏远地区。