通常的工程预算分析方法有：
（1）单方造价指标法。通过对同类项目的每平方米造价的对比，可直接反映出造价的准确性。
（2）分部工程比例。基础、混凝土及钢筋混凝土等各占定额直接费的比例。
（3）专业投资比例。土建、电气、采暖通风等各专业占总造价的比例。
（4）工料消耗指标。分析主要材料每平方米的耗用量的分析。
道路工程内容
a)路基、路面、桥涵、防护、临时工程等章节主要内容基本一致。
b)公路预算定额含有完整的交通工程及沿线设施定额，包括、监控收费、通信、供电照明、绿化工程等内容，而在市政定额中，设备的多用材料费（实际领用甲方材料数量减结算用量的差量乘甲方供应材料超量扣款单价）。同时，要对甲供材料、设备的多领和少领数量也应引起足够重视；多领和少领数量要与现场工程师一起核对确认，并要对其少领和多领原因进行分析，通过分析，进一步验证结算数量的正确性。材料价差严格按材料限价调整。
施工单位施工过程中对技术资料的未能完整归档或有意不建档，造成建设单位在工程竣工后无法建立完整的工程资料档案并按要求报送工程结算所需资料，从而使审计工作周期拉长、风险加大。这个问题也的确存在。不过，按照一般的情况，审计周期是按提供完整的资料开始计算的。除非你自己的要求没有到位，那也怨不得别人。什么叫风险加大？是你审计费用不够用了吧？既然做了审计这个行业，就要有这个思想准备，否则人家建设单位为什么出钱给你啊！建设单位缺乏工程技术专管人员和工程技术专业知识或工程技术人员职业道德水准不高，造成工程项目施工中不合规的变更签证增多，从而使得工程预算随意增大。
工程预算它是指审计人员在审计过各中会同被审计单位有关人员与施工单位有关人员及现场监理人员到建筑现场，对有疑点的隐蔽工程进行挖开核实工程做法与工程量、价款的方法。抽样测定法较为直接，容易验证出问题的真假，但是审计风险较大，所以一般在确有问题时方可实行抽样定点的方式。例如：某年审计某项工程时，审计人员通过了解得知，该项目管道回填施工时未按设计要求进行筛土回填，且未做警示标志。经现场抽样开挖发现有两个标段的部分施工班组未按设计要求施工。
工程预算由于工程建设涉及面广和其本身所具有的复杂性，在其建设过程中，不可避免地发生设计变更、材料设备变更等多种引起工程预算变化的情况。对于采取中标价从签证作为结算方式的工程，更应注意增减费用的审查。应注意设计变更的审查。设计变更单是设计单位在施工中发现需要变更的部位，或是由于建设单位需要改变使用功能、装修标准等而发出的变更通知单。它应是由设计单位、建设单位、施工单位、监理单位协商后共用签署的。审查设计变更时，一要应查验手续是否完备；二要判定该项变更是否引起经济利益上的增减变动，因为有的变更只是技术变更，并不引起经济变更。还要注意查阅竣工图，因为对于工程量增加而引起费用增加的项目。